最為特征性的眼部病變是梨狀核性的白內障，大多數為雙側，亦可單側，常伴有小眼球。出生時白內障可能很小或看不到，必須以檢眼鏡仔細窺查。除白內障外，先天性風疹亦可產生青光眼，與遺傳性的嬰兒青光眼很難鑒別。先天性風疹的青光眼表現為角膜增大和混濁，前房增深，眼壓增高。正常的新生兒亦可有一過性的角膜混濁，能自生消失，與風疹無關。先天性風疹的青光眼必須施行手術，而一過性的角膜混濁不需處理。在視網膜上最常見散在的黑色素斑塊，大小不一。此種色素對視力大多無礙，但其存在對先天性風疹的診斷有幫助。