中醫(yī)學(xué)發(fā)源于先秦，其理論體系形成于戰(zhàn)國到秦漢時(shí)期。中醫(yī)學(xué)理論體系是在中國古代哲學(xué)思想的影響和指導(dǎo)下，在中華民族傳統(tǒng)文化的基礎(chǔ)上，通過長期的醫(yī)療保健的經(jīng)驗(yàn)積累和理論總結(jié)而形成的。

自然科學(xué)是關(guān)于物質(zhì)運(yùn)動(dòng)規(guī)律的理論知識體系。哲學(xué)是關(guān)于世界觀的學(xué)說，是人們對整個(gè)世界（自然、社會(huì)和思維）根本觀點(diǎn)的體系。任何一門自然科學(xué)的形成和發(fā)展都離不開哲學(xué)。必然受著哲學(xué)思想的支配和制約：特別是古代社會(huì)，哲學(xué)與自然科學(xué)尚未徹底分開之時(shí)，顯得尤為密切：中醫(yī)學(xué)屬于古代自然科學(xué)范疇，其理論體系始終沒有脫離古代自然哲學(xué)。中醫(yī)學(xué)以中國古代樸素的唯物論和自發(fā)的辯證法思想，即氣一元論、陰陽五行學(xué)說構(gòu)建其理論體系。哲學(xué)既是世界觀，又是方法論：氣一元論和陰陽五行學(xué)說不僅為中醫(yī)學(xué)提供了樸素的唯物辯證的自然觀和生命觀，皋確立了中醫(yī)學(xué)的整體的研究方法，使中醫(yī)學(xué)以聯(lián)系的、發(fā)展的、全面的觀點(diǎn)去認(rèn)識自然、認(rèn)識生命，借以闡明人與自然、生命本質(zhì)、健康與疾病等。醫(yī)學(xué)`教育網(wǎng)搜集整理中醫(yī)學(xué)運(yùn)用哲學(xué)的概念和范疇，去觀察事物，借以闡明中醫(yī)學(xué)中的一系列問題，并貫穿于中醫(yī)學(xué)理論體系的各個(gè)方面，使之成為中醫(yī)理論體系的重要組成部分。這些哲學(xué)概念和范疇通過中醫(yī)學(xué)的診療實(shí)踐，得到了探索、驗(yàn)證和深化，從而又豐富和發(fā)展了中國古代哲學(xué)理論。中醫(yī)學(xué)雖然來自長期的經(jīng)驗(yàn)積累，但并沒有像其他經(jīng)驗(yàn)科學(xué)而被科學(xué)實(shí)驗(yàn)方法所淘汰，其根本原因在于中醫(yī)學(xué)理論充滿了樸素的唯物論和自發(fā)的辯證法思想，具有深刻的哲學(xué)淵源。