生產(chǎn)單細胞蛋白質(zhì)的微生物種類很多，有酵母菌、細菌、霉菌和擔(dān)子菌等。

　　糖質(zhì)原料：酵母屬和假絲酵母屬為主要生產(chǎn)菌。

　　正烷烴：假絲酵母為最主要利用菌。

　　甲烷：能利用甲烷作為唯一碳源的微生物，主要是細菌，如甲烷假單胞菌等。

　　甲醇：主要以細菌為主，放線菌、酵母菌和霉菌次之。甲烷利用菌也為甲醇利用菌，但反之不一定。甲醇利用菌多數(shù)為革蘭氏陰性細菌。醫(yī)學(xué)教育`網(wǎng)搜集整理

　　乙醇：以酵母占多數(shù)，其次為細菌和霉菌。酵母菌中有假絲酵母屬、酵母屬等。

　　醋酸：細菌中有短桿菌屬等，酵母中有假絲酵母屬等，霉菌中有曲霉屬等。

　　氫氣和碳酸氣：能以CO2為唯一碳源，氫氣為唯一能源的細菌稱為氫細菌。氫細菌在分類學(xué)上為氫單胞菌屬。