藥物結構中不同的官能團的改變可使整個分子的理化性質、電荷密度等發(fā)生變化，進而改變或影響藥物與受體的結合，影響藥物在體內的吸收和轉運，最終影響藥物的藥效，有時會產生毒副作用。

　　1.烴基

　　藥物分子中引入烴基，可改變溶解度、離解度、分配系數(shù)，還可增加位阻，從而增加穩(wěn)定性。

　　2.鹵素

　　鹵索是很強的吸電子基，可影響分子間的電荷分布和脂溶性及藥物作用時間。

　　3.羥基和巰基

　　引入羥基可增強與受體的結合力，增加水溶性，改變生物活性。

　　4.醚和硫醚

　　醚類化合物由于醚中的氧原子有孤對電子，能吸引質子，具有親水性，碳原子具有親脂性，使醚類化醫(yī).學教育網搜集整理合物在脂-水交界處定向排布，易于通過生物膜。

　　5.磺酸、羧酸、酯

　　磺酸基的引入，使化合物的水溶性和解離度增加，不易通過生物膜，導致生物活性減醫(yī).學教育網搜集整理弱，毒性降低。羧酸成鹽可增加水溶性。

　　羧酸成酯可增大脂溶性，易被吸收。

　　6.酰胺

　　在構成受體或酶的蛋白質和多肽結構中含有大量的酰胺鍵，因此酰胺類藥醫(yī).學教育網搜集整理物易與生物大分子形成氫鍵，增強與受體的結合能力。

　　7.胺類