種皮顯微特征在種子類藥材鑒別上特別重要，胚乳和胚常少具或不具鑒別價值。

　　1、種皮——通常具1層種皮（大豆、南瓜），也有2層種皮即外種皮和內(nèi)種皮（蓖麻、芥菜、蕓苔、三色堇）。種皮可是干性的（豆類），也可是肉質(zhì)的（石榴）。

　?、俦砥?mdash;—位于種皮最外層，通常1層薄壁cell組成，也有為石細(xì)胞。

　?、跂艩罴?xì)胞層——有的種子，在表皮內(nèi)側(cè)，有柵欄細(xì)胞層，由1或2-3列狹長細(xì)胞組成。

　　③油cell層——有的種子表皮層下方，有數(shù)列內(nèi)貯揮發(fā)油的細(xì)胞組成，有時常與色素cell相間排列在一起。

　?、苌貙?mdash;—有的種皮表皮層含色素物質(zhì)，有的種子在表皮層下方，具有1-數(shù)列內(nèi)含色素的細(xì)胞層。

　?、莺癖诩?xì)胞層——有的種子表皮內(nèi)層幾乎全為石細(xì)胞組成，如栝樓屬植物，或內(nèi)種皮為石細(xì)胞層（如姜科植物的白豆蔻、陽春砂、草果等）。

　　2、胚乳——由薄壁cell或厚壁性細(xì)胞組成。胚乳細(xì)胞常含大量的淀粉粒、糊粉粒、脂肪油等營養(yǎng)物質(zhì)。

　　3、胚——是種子內(nèi)未發(fā)育的幼小植物體，子葉細(xì)胞為類圓形或多面體，常具細(xì)胞間隙，外層表皮細(xì)胞具1極薄的角質(zhì)層，常無氣孔分布，有的植物在子葉的組織中還含有分泌腔和草酸鈣簇晶。