牙本質的間質為礦化的間質，其中有很細的膠原纖維，主要為Ⅰ型膠原。纖維的排列大部分與牙表面平行而與牙本質小管垂直，彼此交織成網(wǎng)狀。在冠部靠近釉質和根部靠近牙骨質最先形成的牙本質，膠原纖維的排列與小管平行，且與表面垂直，礦化均勻，鏡下呈現(xiàn)不同的外觀，在冠部者稱罩牙本質，厚約10～15μm；在根部者稱透明層。在罩牙本質和透明層以內(nèi)的牙本質稱髓周牙本質。

　　間質中羥磷灰石晶體比釉質中的小，這些晶體沉積于基質內(nèi)，其長軸與膠原纖維平行。

　　間質中的礦化并不是均勻的，在下列不同區(qū)域其鈣化程度不同：

　　1.小管周牙本質

　　在鏡下觀察牙本質的橫剖磨片時，可清楚見到圍繞成牙本質細胞突起周圍的間質與其余部分不同醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理，呈環(huán)形的透明帶，構成牙本質小管的壁，稱為管周牙本質。管周牙本質鈣化程度高，含膠原纖維少。

　　2.小管間牙本質

　　位于管周牙本質之間。其中膠原纖維較多，礦化較管周牙本質低。

　　3.前期牙本質

　　牙本質的形成是持續(xù)性的，在成牙本質細胞和礦化牙本質之間是一層未鈣化的牙本質，稱為前期牙本質。