醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)整理了溫州醫(yī)學(xué)院科研機(jī)構(gòu)如下：

截至2014年2月，學(xué)校擁有國家工程技術(shù)研究中心1個，省部共建國家重點實驗室培育基地1個，省部級及以上重點實驗室（研究中心）11個，其中包括省部共建教育部重點實驗室1個、省部共建教育部工程研究中心1個、衛(wèi)生部研究中心1個、衛(wèi)生部重點實驗室1個、浙江省重點實驗室7個。

國家工程技術(shù)研究中心：國家眼視光工程技術(shù)研究中心；

省部共建教育部工程研究中心：現(xiàn)代眼視光技術(shù)和裝備教育部工程研究中心；

衛(wèi)生部研究中心：衛(wèi)生部視光學(xué)研究中心；

國家重點實驗室培育基地：醫(yī)學(xué)教育網(wǎng)搜集|整理眼視光學(xué)和視覺科學(xué)；

浙江省重點實驗室：

浙江省眼視光學(xué)重點研究實驗室；

浙江省醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)重點實驗室；

浙江省眼視光學(xué)重點研究實驗室；

浙江省生物技術(shù)制藥工程重點實驗室；

浙江省模式生物技術(shù)與應(yīng)用重點實驗室；

浙江省麻醉學(xué)重點實驗室；

浙江省神經(jīng)老化與疾病研究重點實驗室；

省部共建教育部重點實驗室：檢驗醫(yī)學(xué)；

衛(wèi)生部重點實驗室：衛(wèi)生部視覺科學(xué)研究重點實驗室；

協(xié)同創(chuàng)新中心；

浙江省“2011協(xié)同創(chuàng)新中心”：眼視光行業(yè)產(chǎn)業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心。