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廈門市藥學會成立于1963年，原稱中國藥學會廈門分會。主要發(fā)起人有王永明、邱文慶、陳思渠、劉英、彥青禧、廖在根、胡炯祥等。成立時會員40多人。文革期間停止活動。

1979年10月31日，廈門市藥學會恢復正常活動醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理，在廈門武裝部會場成立第一屆理事會，共有理事23人，掛靠在廈門市衛(wèi)生局。本屆老會員登記21人，發(fā)展會員79人，共有會員100人。

1982年8月1日，在思明醫(yī)院召開第二屆會員代表大會暨1981年學術(shù)年會，會議選出新一屆理事會，共有理事19人。會議收到論文36篇，選出10篇論文在大會中交流。本屆發(fā)展會員19人，共有會員119人。

1983年元月5日，本會與市醫(yī)學會、市中西醫(yī)結(jié)合研究會、市護理會、市中醫(yī)藥學會聯(lián)合召開1982年學術(shù)年會。大會以“有分有合”的方式舉行。聯(lián)合舉行了開幕式及閉幕式，同時各學會進行了學術(shù)交流活動。年會共收到藥學學術(shù)論文18篇，大會上交流論文8篇。在本屆年會上，藥學會全體會員代表選舉了第三屆理事會，共有理事18人。

1984年12月15日在市衛(wèi)生局禮堂召開藥學會會員大會，選舉產(chǎn)生了23名理事組成第四屆理事會。本屆發(fā)展新會員74人，共有會員213人。