麻醉科成立于1956年。在西南地區(qū)率先成立麻醉學教研室。1985年經(jīng)國務院批準為碩士學位授予點。1999年經(jīng)國家教委批準，正式成立重慶醫(yī)科大學麻醉學系。2005年經(jīng)國務院批準為一級臨床醫(yī)學學科博士點。 歷屆主任：董紹賢、蔣夏、房秀生、陳敦敏、李秀英。

現(xiàn)任主任：閔蘇、陳萍。

該科立足臨床麻醉并已發(fā)展成為集醫(yī)療、教學、科研為一體的二級臨床學科。是重慶及西南地區(qū)麻醉技術力量和麻醉學專業(yè)教學實力最雄厚的科室及系部之一。擁有全國第一個麻醉學教學實驗室，一個重慶市級醫(yī)學中心（重慶市第一個疼痛治療中心）。已形成了較為完善的現(xiàn)代麻醉學科體系，即臨床麻醉，急救與復蘇，PACU，疼痛診療。

全科有教授3位、副教授9位。博士導師1名、碩士導師7名。40歲以下師資均為博士和碩士。多人出國學習，目前有一名赴美國進行麻醉藥理學的博士后研究。