北京中醫(yī)藥大學東直門醫(yī)院創(chuàng)建于1958年，是一所集醫(yī)療、教學、科研為一體的大型綜合性中醫(yī)院。是全國唯一一所進入國家“211工程”建設的高等中醫(yī)藥院校——北京中醫(yī)藥大學的第一臨床醫(yī)學院，并率先成為全國示范中醫(yī)醫(yī)院、三級甲等中醫(yī)院和國家食品藥品監(jiān)督管理局認定的國家藥物臨床試驗機構。是北京市醫(yī)療保險定點醫(yī)療機構，民政部“醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理明天計劃”腦癱患兒手術康復和“點燃心希望”先心病治療定點醫(yī)院。2010年，醫(yī)院被確立為“國家中醫(yī)藥發(fā)展綜合改革試驗區(qū)”建設示范基地和戰(zhàn)略合作簽約單位。2011年8月6日，原通州區(qū)中醫(yī)醫(yī)院與該院整合，并正式命名為北京中醫(yī)藥大學東直門醫(yī)院東區(qū)。醫(yī)院開創(chuàng)性地于1991年最早在歐洲建立了分院——德國魁茨汀醫(yī)院，作為重要的中醫(yī)藥國際交流窗口，載入中德外交史冊。