上海醫(yī)藥高等?？茖W校努力實踐“秉學厚德，擎術(shù)濟生”的校訓，對接國家、上海衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展，建設(shè)具有上海品牌、國內(nèi)示范、國際競爭力的衛(wèi)生類高職院校，培養(yǎng)具有國際競爭力、高素質(zhì)、技能型的醫(yī)藥高等職業(yè)技術(shù)人才。學校堅持“以服務(wù)為宗旨、以就業(yè)為導向”的辦學理念，探索“工學結(jié)合”的相關(guān)醫(yī)學類專業(yè)人才培養(yǎng)模式，扎實推進“校企（院）合作、產(chǎn)學一體化”的辦學模式和發(fā)展道路。學校聚焦國際先進標桿，引入國際行業(yè)標準，加強教學內(nèi)涵建設(shè)，形成了國際化合作辦學特色。

2006年，學校整體搬遷至上海國際醫(yī)學園區(qū)，新校區(qū)建設(shè)完成。同年，在上海市教委、交大醫(yī)學院的關(guān)心指導下，全校師生共同奮斗，學校成功躋身本市惟一首批重點建設(shè)的國家示范性高職院校行列。經(jīng)過十年勵精圖治的艱苦努力，特別是三年“國家示范性高等職業(yè)院校”的建設(shè)過程，學校的辦學規(guī)模、質(zhì)量、結(jié)構(gòu)、效益協(xié)調(diào)發(fā)展，逐漸形成了工學結(jié)合、特色鮮明的專業(yè)結(jié)構(gòu)體系、敬業(yè)愛崗的師資隊伍、國家級和市級教學團隊與教學老師的示范效應(yīng)、環(huán)境與設(shè)施的實驗實訓中心、綜合能力較強、職業(yè)素養(yǎng)較高的學生、良好的社會聲譽與就業(yè)環(huán)境、成果顯著的國際化辦學特色等一系列優(yōu)勢條件。

2009年，學校取得了示范校項目驗收和新一輪高職高專人才培養(yǎng)評估的“雙豐收”，得到專家、領(lǐng)導的一致好評。這些來之不易的成果大大提升了學校的辦學實力，為學校的進一步發(fā)展奠定了更為堅實的基礎(chǔ)。全校上下以此為動力，繼往開來，奮發(fā)有為，把學校建設(shè)成為匯聚產(chǎn)學結(jié)合、醫(yī)學|教育|網(wǎng)搜集整理校企（院）聯(lián)合、工學融合的醫(yī)藥高等職業(yè)技術(shù)人才培養(yǎng)高地。