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水是生物系統(tǒng)的基本溶劑，藥物要轉運擴散至血液或體液，需要溶解在水中，即要求一定的水溶性（親水性）。而藥物要通過脂質的生物膜需要一定的脂溶性（親脂性）。

過大或過小的水溶性和脂溶性均不利于藥物的吸收。

藥物的脂溶性和水溶性的相對大小一般以脂水分配系數(shù)來表示。

P=C_o/C_w

脂水分配系數(shù)：化合物在互不相溶的非水相和水相中分配平衡后，在非水相中的濃度C_o和水相中的濃度C_w的比值，常取其對數(shù)lgP，且廣泛采用正辛醇作為非水相測定脂水分配系數(shù)。

藥物的化學結構決定其水溶性和脂溶性，改變分子結構將顯著影響脂水分配系數(shù)。例如在分子中引入極性較大的基團使脂水分配系數(shù)下降，反之使脂溶性增加。各類藥物因作用不同，分別要求不同的脂溶性，比如，作用于中樞神經系統(tǒng)的藥物需要通過血腦屏障，應具有較大的脂溶性。研究表明，全身麻醉藥和鎮(zhèn)靜催眠藥的活性與其lgP有關，因為全身麻醉藥不是與體內的某種特異性受體結合，而可能是與腦液中的水分子形成微晶水合物，即和水分子以氫鍵連接形成一個籠狀復合物，全身麻醉藥的分子正好封閉于其中。這種微晶水合物會改變維持醒覺狀態(tài)所必須的電脈沖傳導，從而引起了麻醉作用。因而全身麻醉藥的藥效主要由其理化性質決定。

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