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【摘要】 建立脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者血清蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜,觀察脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者與正常人血清蛋白質(zhì)差異表達(dá)情況。方法:采用反復(fù)凍融法抽提血清蛋白質(zhì),以優(yōu)化的雙向電泳技術(shù)分離血清蛋白質(zhì),建立脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者與正常人血清蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜,并采用二維電泳圖譜專用軟件對(duì)所得結(jié)果進(jìn)行圖譜分析。采用基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時(shí)間質(zhì)譜法對(duì)兩組間比較所得目標(biāo)蛋白質(zhì)點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜鑒定。結(jié)果:通過(guò)雙向電泳,建立血清蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜,選取具有明顯差異的蛋白點(diǎn)21個(gè)進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,共鑒定出8種蛋白質(zhì)。結(jié)論:通過(guò)蛋白質(zhì)組技術(shù)快速建立脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者血清蛋白表達(dá)圖譜及質(zhì)譜分析,可為進(jìn)一步研究其發(fā)病機(jī)制及治療手段提供實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】 重癥肌無(wú)力; 蛋白質(zhì)組; 電泳; 乙酰膽堿受體
重癥肌無(wú)力(myasthenia gravis, MG)主要是由乙酰膽堿受體(acetylcholine receptor, AchR)抗體介導(dǎo)的,補(bǔ)體參與,細(xì)胞免疫依賴性,針對(duì)神經(jīng)肌肉接頭處突觸后膜上乙酰膽堿受體的自身免疫性疾病。對(duì)于MG的治療至今仍缺乏有效手段。蛋白質(zhì)組技術(shù)利用其核心技術(shù)雙向電泳(two-dimen-sional gel electrophoresis, 2-DE)對(duì)組織或細(xì)胞總蛋白質(zhì)進(jìn)行分離[1],并通過(guò)正常與疾病組織的差異表達(dá)蛋白比較,找到與該疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)分子。本研究通過(guò)建立脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者和正常人血清總蛋白質(zhì)的雙向電泳圖譜,尋找有明顯差異性表達(dá)的蛋白,對(duì)差異表達(dá)的蛋白進(jìn)行鑒定和研究,為進(jìn)一步研究MG發(fā)病機(jī)制以及MG診斷治療提供實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 血清采集 MG患者全血來(lái)自2004~2005年就診于遼寧中醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院的門(mén)診患者。根據(jù)典型臨床表現(xiàn)、新斯的明試驗(yàn)、低頻重復(fù)電刺激及單纖維肌電圖等確診,無(wú)其他自身免疫性疾病,未經(jīng)其他免疫抑制治療,并參照1994年版《中醫(yī)病證診斷療效標(biāo)準(zhǔn)》辨證為脾腎虛型。正常人血清取自同時(shí)期健康志愿者。-70 ℃冰箱冷凍保存?zhèn)溆谩?/P>
1.2 主要試劑 固相pH梯度干膠條IPG strip(Amersham公司產(chǎn)品, 非線性pH 3~10, 7 cm)。3-[3-(膽酰胺基丙基)二甲氨基]丙磺酸鹽{3-[(3-cholamidopropyl) dimethylamino]-1-propanesul-fonate, CHAPS},二硫蘇糖醇(DL-dithiothreitol, DTT),三丁基膦(tributyl phosphine, TBP),尿素,硫脲,碘乙酰胺(iodoacetamide, IAA),丙烯酰胺(acrylamide)、甲雙丙烯酰胺(N, N‘-methylenebi-sacrylamide),四甲基乙二胺(N, N, N, N-tetram-ethyl-ethylenediamine, TEMED),過(guò)硫酰胺(am-monium persulfate, APS),三羥甲基氨基甲烷[tris (hydroxymethyl) aminomethane]、甘氨酸(glycine, Gly)和十二烷基磺酸鈉(sodium dodecyl sulfate, SDS)均為Bio-Rad公司產(chǎn)品。瓊脂糖為華美生物公司產(chǎn)品。其他試劑均使用國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭K腥芤壕肕illiQ水配制。
1.3 主要儀器 高速冷凍離心機(jī),德國(guó)Eppendorf公司產(chǎn)品;EttanTMIPGphorⅡ,Amersham Biosci-ences公司產(chǎn)品;P-2000分光光度儀,Hitachi公司產(chǎn)品;SE-600電泳儀,Amersham公司產(chǎn)品;純水裝置,Millipore公司產(chǎn)品;GS-710光密度掃描儀,Bio-Rad公司產(chǎn)品;冷卻水循環(huán)系統(tǒng),Cole-Parmer公司產(chǎn)品;Bruker-Daltonics AutoFlex TOF-TOF LIFTMass Spectrometer,美國(guó)Bruker-Daltonics公司產(chǎn)品;LCQ Deca XP Plus,美國(guó)Thermo Finnigan公司產(chǎn)品。
1.4 雙向電泳
1.4.1 血清總蛋白質(zhì)的提取及定量 血清-70 ℃反復(fù)凍融4次后,用Agilent Multiple Affinity Re-moval Column處理去除高豐度蛋白。使用Agilent 5K超濾管進(jìn)行濃縮除鹽,凍干回收的樣品,-70 ℃保存。用裂解液(9 mol/L 尿素、4% CHAPS、 65 mmol/L DTT和cocktail酶抑制劑)進(jìn)行復(fù)溶,并采用考馬斯亮藍(lán)法進(jìn)行蛋白質(zhì)定量。
1.4.2 等電聚焦 自-20 ℃取出的膠條,室溫下平衡10 min,以500 μg上樣量在每份樣本中加入上樣緩沖液(8 mol/L尿素、2% CHAPS、1% Bio-lyte和1% TBP)以及標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)分子,上樣于泡脹槽中,加入礦物油覆蓋。程序設(shè)置如下:30 V 12 h,500 V 1 h,1 000 V 1 h,8 000 V 6 h.恒溫20 ℃。等電聚焦電泳后IPG膠條在平衡液1(Tris-base 50 mol/L 、尿素 6 mol/L、甘油 30%、SDS 2%、溴酚藍(lán)0.002%和DTT 100 mg)中于振蕩器上振蕩 15 min; 然后置入平衡液2(成分同平衡液1,用 400 mg 碘乙酰胺代替100 mg DTT)同樣于振蕩器上振蕩15 min.
1.4.3 SDS-PAGE垂直電泳 采用12.5%的均勻SDS2聚丙烯酰胺凝膠(水23.2 ml,30%丙烯酰胺溶液32.46 ml,1.5 mol/L Tris-HCl緩沖液pH 8.8 20 ml,10% SDS 0.8 ml,10% APS 0.4 ml,TEMED 3.76 μl,膠總體積80 ml)。將平衡后的IPG膠條移至凝膠的上方,膠條一端放入低分子量蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn),0.5%的瓊脂糖封膠。上下槽加入電極緩沖液(Tris 5 mmol/L,Gly 192 mmol/L和SDS 0.1%)。初始電流為每塊膠40 mA,電泳20 min,然后以每塊膠60 mA電流,直至溴酚藍(lán)前沿。
1.4.4 銀染色 電泳結(jié)束后,采用硝酸銀染色法,通過(guò)固定,硝酸銀染色,顯影,停顯及脫色,至背景清晰。
1.5 圖像分析 每個(gè)樣品常規(guī)進(jìn)行3次二維電泳,用GS-710光密度掃描儀對(duì)電泳后的膠圖分別進(jìn)行掃描,所得掃描圖像輸入計(jì)算機(jī),采用Image-master軟件對(duì)圖像進(jìn)行背景消減、蛋白質(zhì)點(diǎn)檢測(cè)和校正,獲取蛋白質(zhì)點(diǎn)的位置坐標(biāo)和表達(dá)量等分析。選取 Ratio ≥1.5的蛋白質(zhì)點(diǎn)認(rèn)為有差異。所有數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析均采用SPSS 12.0軟件,統(tǒng)計(jì)學(xué)分析采用 t 檢驗(yàn)。
1.6 基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時(shí)間質(zhì)譜分析 用手術(shù)刀片切下膠上目標(biāo)條帶,進(jìn)行切膠、膠上胰蛋白酶酶解 20 h ,抽提酶解肽段,Zip Tip脫鹽后點(diǎn)樣,行基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)分析(飛行管長(zhǎng)2.7 m,加速電壓 20 kV ,反射電壓23 kV)。將第1級(jí)質(zhì)譜得到的肽片段質(zhì)量指紋圖譜、肽質(zhì)量指紋圖譜與第2級(jí)質(zhì)譜得到的肽序列信息一起用來(lái)檢索蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù),找出匹配的蛋白質(zhì)。
1.7 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索 將質(zhì)譜鑒定所得的肽質(zhì)量指紋譜(peptide mass fingerprinting, PMF)數(shù)據(jù)于Bio-Works(Thermo Finnigan, San Jose, CA)軟件搜索相應(yīng)的庫(kù)。搜索使用的數(shù)據(jù)庫(kù)為IPI human蛋白庫(kù)(SEQUEST結(jié)果過(guò)濾參數(shù)為:當(dāng)Charge+1,Xcorr≥1.9;當(dāng)Charge+2,Xcorr≥2.2;當(dāng)Charge+3,Xcorr≥3.75;其中DelCN≥0.1)以及NCBI上 Homo sapiens的非冗余蛋白庫(kù)(redundant data-base)。檢索參數(shù)為胰蛋白酶解;氨基酸固定修飾方式為脲甲基半胱氨酸;模式為單同位素峰;肽片斷最大誤差控制在100 ppm;肽片斷最大分子量誤差為±0.5 Da;每個(gè)肽允許有1個(gè)不完全裂解位點(diǎn)。
2 結(jié)果
2.1 脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者血清雙向電泳圖譜 的建立及分析 經(jīng)2-DE技術(shù)及銀染色后,得到了兩組血清的雙向凝膠電泳圖,并于相同的條件下重復(fù)實(shí)驗(yàn)3次。在正常對(duì)照組細(xì)胞蛋白質(zhì)組雙向電泳圖譜上可觀察到1 463±179個(gè)蛋白點(diǎn),而脾腎虛型重癥肌無(wú)力組可見(jiàn)到1 508±89個(gè)蛋白點(diǎn)。見(jiàn)圖 1~3 .
2.2 差異蛋白質(zhì)點(diǎn)的鑒定和功能分析 通過(guò)對(duì) 2-DE 凝膠上差異表達(dá)的21個(gè)蛋白質(zhì)斑點(diǎn)進(jìn)行切割,用胰蛋白酶消化后進(jìn)行MALDI-TOF-MS檢測(cè)。 21個(gè) 點(diǎn)中獲得了13張PMF(圖4),另有8個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)未獲得PMF.將查詢到的結(jié)果再結(jié)合 2-DE 圖譜上相應(yīng)蛋白質(zhì)的分子質(zhì)量和PI值等進(jìn)行綜合分析,在獲得的13張PMF數(shù)據(jù)中有5個(gè)無(wú)可信搜索結(jié)果。在數(shù)據(jù)庫(kù)中匹配到符合結(jié)果要求的已知蛋白質(zhì)有 8個(gè) .本次檢測(cè)的8個(gè)質(zhì)點(diǎn)在脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者血清圖譜中表達(dá)均增加,且差異都具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。鑒定的8個(gè)質(zhì)點(diǎn)分別為:載脂蛋白A-I(1382號(hào)及1438號(hào)質(zhì)點(diǎn))、白蛋白、胎球蛋白B的前體、載脂蛋白E的前體、轉(zhuǎn)甲狀腺蛋白前體、泰素耐藥相關(guān)基因-3和前血清淀粉樣蛋白P成分。這些蛋白分布廣泛,并具有重要生物學(xué)功能。見(jiàn)表1 和2.
圖1 正常人血清雙向電泳圖譜(略)
Figure 1 Two-dimensional electrophoresis map of normal persons‘ serum
圖2 脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者血清雙向電泳圖譜(略)
Figure 2 Two-dimensional electrophoresis map of MG patients‘ serum
圖3 正常人和脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者血清蛋白差異性比較局部放大圖(略)
Figure 3 Augmented figure of differentially expressed proteins (comparison between MG group and normal group)
圖4 772號(hào)樣品肽指紋圖譜(略)
Figure 4 Peptide mass fingerprinting of Sample 772
表1 通過(guò)MALDI-TOF-MS質(zhì)譜IPI human蛋白庫(kù)搜索情況列表(略)
Table 1 Differentially expressed proteins between MG patients and normal persons identified by2-DE and MALDI-TOF-MS or ESI-MS analysis of IPI human
表2 通過(guò)MALDI-TOF-MS質(zhì)譜NCBI非冗余蛋白庫(kù)搜索情況列表(略)
Table 2 Differentially expressed proteins between MG patients and normal persons identified by2-DE and MALDI-TOF-MS or ESI-MS analysis of NCBI
3 討論
免疫功能調(diào)節(jié)異常是重癥肌無(wú)力重要發(fā)病機(jī)制之一?,F(xiàn)已證實(shí),AchR-ab阻滯降解突觸后膜受體,使自身抗原主要為煙堿型乙酰膽堿受體活性降低,突觸后膜表面積減少,神經(jīng)-肌肉接頭傳遞障礙,出現(xiàn)肌無(wú)力癥狀,T細(xì)胞在該免疫應(yīng)答過(guò)程中起關(guān)鍵作用[2,3]。90%以上病人血清中可檢出AchR-ab[4]。AchR-ab已成為最重要的MG實(shí)驗(yàn)室診斷檢測(cè)指標(biāo)。該疾病與遺傳也有密切關(guān)系。重癥肌無(wú)力需要長(zhǎng)期治療,且藥物毒副作用大[5]。重癥肌無(wú)力屬中醫(yī)“瘺證”范疇,是以眼瞼下垂,四肢軟弱無(wú)力,晨輕暮重,漸進(jìn)性加重或伴有吞咽困難、構(gòu)音不清為特征的疾病。其根本病機(jī)是脾腎虧虛。蛋白質(zhì)組技術(shù)包括蛋白分離技術(shù)和鑒定技術(shù),也即主要通過(guò)2-DE或二維液相色譜分析等蛋白質(zhì)分離技術(shù),建立蛋白質(zhì)組圖譜,并應(yīng)用表面增強(qiáng)激光解吸電離或基質(zhì)輔助的激光解吸離子化質(zhì)譜技術(shù),并結(jié)合飛行時(shí)間-質(zhì)譜系統(tǒng)對(duì)結(jié)合的蛋白質(zhì)或多肽進(jìn)行質(zhì)譜分析鑒定。雙向電泳技術(shù)是蛋白質(zhì)組研究的核心技術(shù)[6~8]。2-DE技術(shù)最大的優(yōu)勢(shì)在于它可以對(duì)細(xì)胞或組織內(nèi)復(fù)雜的蛋白質(zhì)組分進(jìn)行整體性分析,從而可以分析不同生理和病理?xiàng)l件下蛋白質(zhì)組的表達(dá)變化。本研究通過(guò)雙向電泳技術(shù),成功建立了脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者血清2-DE圖譜。其中在正常對(duì)照組細(xì)胞蛋白質(zhì)組雙向電泳圖譜上觀察到了1 463±179個(gè)蛋白點(diǎn),而重癥肌無(wú)力組共觀察到1 508±89個(gè)蛋白點(diǎn)。PMF是對(duì)蛋白酶解或降解后所得到的多肽片段質(zhì)量圖譜。對(duì)質(zhì)譜分析所得肽片與多肽蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)中蛋白質(zhì)的理論肽片進(jìn)行比較,從而判別所測(cè)蛋白是已知還是未知,并在一定質(zhì)量誤差范圍內(nèi)記錄每個(gè)蛋白質(zhì)肽質(zhì)量理論值與樣品蛋白質(zhì)肽質(zhì)量測(cè)定值相符的數(shù)目,理論值與測(cè)定值相符數(shù)量最多的蛋白質(zhì)即可能為需鑒定的樣品蛋白質(zhì)。由于不同的蛋白質(zhì)具有不同的氨基酸序列,因而不同蛋白質(zhì)所得肽片具有指紋的特征。應(yīng)用肽質(zhì)指紋數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)搜索是PMF分析蛋白質(zhì)的最后一步,本研究所鑒定的21個(gè)點(diǎn)中共獲得了13張肽質(zhì)量指紋圖譜,并在相應(yīng)數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)蛋白進(jìn)行了檢索。本研究初步鑒定的蛋白質(zhì)點(diǎn)中,在數(shù)據(jù)庫(kù)中匹配到符合結(jié)果要求的已知蛋白質(zhì)有8個(gè)。這8個(gè)點(diǎn)在重癥肌無(wú)力患者血清圖譜中表達(dá)均增加。具體而言,脾腎虛型重癥肌無(wú)力患者載脂蛋白A-I、載脂蛋白E的前體蛋白、白蛋白、胎球蛋白B的前體、轉(zhuǎn)甲狀腺蛋白前體、泰素耐藥相關(guān)基因-3和前血清淀粉樣蛋白P成分均明顯高于正常人。這些蛋白大都與物質(zhì)代謝相關(guān),能促進(jìn)肌肉淀粉樣變。1587號(hào)轉(zhuǎn)甲狀腺蛋白是含4個(gè)相同子單元的四聚體,在單體的情況下可形成淀粉樣纖維,造成組織纖維化,并最終導(dǎo)致肌無(wú)力及肌萎縮;其主要在人體的肝臟中合成,通常形成致病的類淀粉沉積。其中1401號(hào)樣品為前血清淀粉樣蛋白P(pre-serum amyloid P, pre-SAP)成分。SAP是一種人類免疫系統(tǒng)的重要蛋白[9],廣泛存在于淀粉類物質(zhì)中,被認(rèn)為與慢性炎癥和自身免疫疾病相關(guān)。與鑒定的958號(hào)樣品匹配的為泰素耐藥相關(guān)基因-3(taxol resistant associated gene-3, TRAG-3)。TRAG-3是Duan等[10]在尋找泰素耐藥基因時(shí)發(fā)現(xiàn)的一個(gè)新的CT抗原,其編碼的蛋白屬于腫瘤/睪丸抗原家族成員。TRAG-3是一個(gè)與腫瘤相關(guān)的抗原,被作為一個(gè)免疫治療的靶標(biāo)。有研究發(fā)現(xiàn),TRAG-3細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞表位負(fù)載樹(shù)突狀細(xì)胞疫苗在體外能夠有效激發(fā)抗瘤細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞的免疫反應(yīng)[11]。本研究提示,這些基因或蛋白質(zhì)還可能與重癥肌無(wú)力發(fā)病的免疫機(jī)制相關(guān),但尚待進(jìn)一步驗(yàn)證。重癥肌無(wú)力是一與免疫相關(guān)的疾病,其發(fā)病的具體分子機(jī)制尚不十分明確。本研究通過(guò)雙向電泳 及質(zhì)譜分析技術(shù),對(duì)照正常組,鑒定了8個(gè)差異表達(dá)蛋白,這為進(jìn)一步研究該疾病的分子機(jī)制提供了基礎(chǔ)。
4 致謝
感謝龍華醫(yī)院科研實(shí)驗(yàn)室及中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)院蛋白質(zhì)組研究分析中心。
【參考文獻(xiàn)】
1 Hanash S. Disease proteomics. Nature. 2003; 422(6928): 226-232.
2 Lan RY, Ansari AA, Lian ZX, et al. Regulatory T cells: development, function and role in autoimmunity. Autoimmun Rev. 2005; 4(6): 351-363.
3 Inada K, Okumura M, Shiono H, et al. Role of positive selection of thymoma-associated T cells in the pathogenesis of myasthenia gravis. J Surg Res. 2005; 126(1): 34-40.
4 Oda K, Shibasaki H. Myasthenia gravis: antibodies to extracellularly exposed antigenic determinants of acetyl-choline receptor. Neurology. 1986; 36(10): 1374-1377.
5 Sieb JP. Myasthenia gravis: emerging new therapy op-tions. Curr Opin Pharmacol. 2005; 5(3): 303-307.
6 Wasinger VC, Cordwell SJ, Cerpa-Poljak A, et a1. Pro-gress with gene-product mapping of the Mollicutes: My-coplasma gcoitalium. Electrophoresis. 1995; 16(7): 1090-1094.
7 Petricoin EF, Zoon KC, Kohn EC, et al. Clinical pro-teomics: translating benchside promise into bedside reality. Nat Rev Drug Discov. 2002; 1(9): 683-695.
8 Corthals GL, Wasinger VC, Hochstrasser DF, et al. The dynamic range of protein expression: a challenge for proteomic research. Electrophoresis. 2000; 21(6): 1104-1115.
9 Ho JG, Kitov PI, Paszkiewicz E, et al. Ligand-assisted aggregation of proteins. Dimerization of serum amyloid P component by bivalent ligands. J Biol Chem. 2005; 280(36): 31999-32008.
10 Duan Z, Feller AJ, Toh HC, et al. TRAG-3, a novel gene, isolated from a taxol-resistant ovarian carcinoma cell line. Gene. 1999; 229(1-2): 75-81.
11 Zhu B, Chen ZT, Cheng XM, et al. In vitro induction of immune response by dendritic cells pulsed with TRAG-3-derived cytotoxic T lymphocyte epitope. Zhonghua Zhong Liu Za Zhi. 2004; 26(12): 709-712. Chinese with abstract in English.朱波, 陳正堂, 程曉明, 等。 泰素耐藥相關(guān)基因-3細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞表位負(fù)載樹(shù)突狀細(xì)胞疫苗的體外免疫效應(yīng)研究。 中華腫瘤雜志。 2004; 26(12): 709-712.
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