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隱孢子蟲生活史有滋養(yǎng)體、裂殖體、配子體、合子和卵囊5個發(fā)育階段，其中卵囊是感染階段。

卵囊呈圓形或橢圓形，直徑4～6 um，囊壁光滑、無色，成熟卵囊內(nèi)含4個呈月牙形的子孢子和1個殘留體。在改良抗酸染色標本中，卵囊為玫瑰紅色，背景為藍綠色，囊內(nèi)子孢子排列不規(guī)則，殘留體為棕色顆粒狀 。

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