卡爾·林奈最初將歐洲百合的學名描述為LiliumMartagonmontanummajus,floribusreflexis，最初是于1477年用英語記錄。其種加詞martagon的起源有多種說法。一種語源是名稱源自奧斯曼帝國的蘇丹穆罕默德一世（1413年－1421在位）佩戴的一種土耳其頭巾martagan，是一種新式的伊斯蘭包頭巾，因為其花瓣反卷，與這種頭巾類似。另一語源是名稱來自戰(zhàn)神瑪爾斯的名字Mars（屬格martis），因為煉金術士認為歐洲百合的形態(tài)與金屬的狀態(tài)變化不無關系。歐洲百合的英語俗名Martagon或Turk'scaplily都與第一種語源有關，而其德語俗名Türkenbund也是外來語，源自土耳其頭巾turban。