針對慢性乙型肝炎有多種藥物：α干擾素、PEG干擾素、恩替卡韋、拉米夫定、替比夫定和阿德福韋。此外還有其它藥物目前正在試驗階段。每種藥物的有效性差別不大，但對于具體患者這可能因人而異。治療方案應由醫(yī)師針對病人的具體情況制定。

干擾素針劑（IFN）和抗病毒口服藥是兩類完全不同的抗乙肝病毒藥：抗病毒口服藥有直接抗乙肝病毒作用，抑制病毒復制的作用較強，控制癥狀較快，極大多數病人都能獲得治療效果；干擾素也有抗病毒作用，但主要是免疫調節(jié)劑，每個病人對激發(fā)免疫的反應不一樣，不是每個病人都有效。

抗病毒口服藥沒有免疫效應，故數年內不能停藥，停藥后多數會復發(fā)；醫(yī)學|教育|網搜集整理干擾素治療成功的病人已經激發(fā)了充分的免疫功能，對“大三陽”的清除率較高，轉換為“小三陽”后停藥能持續(xù)抑制病毒復制，使炎癥持續(xù)緩解，停藥后復發(fā)較少，抗病毒效果比較穩(wěn)定，治療有效的病人數年內可能“小三陽”清除而痊愈。

抗乙肝病毒藥物批準的只有2類干擾素（普通干擾素和聚乙二醇干擾素）和4種抗病毒口服藥（核苷類藥）。普通干擾素有多種國產藥；聚乙二醇干擾素是長效制劑，有2種商品：派羅欣和配樂能。核苷類藥有拉米夫定（賀普?。?、阿德福韋（賀維力）恩替卡韋（博路定）和替比夫定（素比伏）。

中國醫(yī)藥市場正在整頓中，有些藥物尚未批準就做廣告；有些藥物雖作為護肝藥已批準，但并未批準其作為抗病毒藥物。規(guī)范的醫(yī)院和規(guī)范的醫(yī)生只能用規(guī)范的藥物。