（一）阿米巴痢疾

起病一般緩慢，少有毒血癥癥狀，里急后重感較輕，大便次數(shù)亦較少，腹痛多在右側，典型者糞便呈果醬樣，有腐臭。鏡檢僅見少許白細胞、紅細胞凝集成團，常有夏科-雷登氏結晶體，可找到阿米巴滋養(yǎng)體。乙狀結腸鏡檢查，見粘膜大多正常，有散在潰瘍。細菌性痢疾易并發(fā)肝膿腫。

（二）流行性乙型腦炎

細菌性痢疾表現(xiàn)和流行季節(jié)與菌?。ㄖ匦突蛑卸拘停┫嗨疲笳甙l(fā)病更急，醫(yī)學教育|網(wǎng)搜集進展迅猛、且易并發(fā)休克，可以溫鹽水灌腸并做鏡檢及細菌培養(yǎng)。此外，細菌性痢疾尚應與沙門氏菌感染、副溶血弧菌食物中毒、大腸桿菌腹瀉、空腸彎曲菌腸炎、病毒性腸炎等相鑒別。慢性菌痢應與慢性血吸蟲病、直腸癌、非特異性潰瘍性結腸炎等鑒別。