HIV-1和HIV-2型在傳播和疾病進展方面是顯著不同的，HIV-2顯示一種較低的性傳播和母嬰傳播，并且較HIV-1有更長的潛伏期才發(fā)展成為艾滋病。但在HIV-1型內各亞型之間，其傳播與疾病進展是否有顯著性差異仍然沒有明確結論。一方面，有些報道顯示各亞型之間在影響其傳播和疾病進展有顯著差異，例如，一項在塞內加爾婦女性服務人群中的前瞻性調查顯示，感染了HIV-1A亞型的婦女比感染了HIV-1其它亞型的婦女進展為AIDS的可能性少八倍。另`一項在對肯尼亞HIV-1陽性懷孕婦女群體調查也顯示，HIV-1C亞型感染者比A或D亞型感染者有更高的病毒載量和較低的CD4細胞計數(shù)。而病毒載量和CD4計數(shù)是顯示HIV疾病進展最重要的指標。另有報道認為，在感染C亞型的病人中大多缺乏輔助性受體CXCR4，而在B亞型感染者中，大多數(shù)具有這一受體，而具有這一輔助性受體被認為在臨床上會有較快的疾病進展。另一方面，也有大量研究結果與上述結論相反，例如，在以色列的一項研究表明，B亞型和C亞型的HIV感染者其醫(yī)學教育|網搜集整理疾病進展是沒有差異的。另一項在瑞典的研究也表明，A、B、C及D亞型的HIV感染者其疾病進展是沒有差異的。在亞型是否對HIV的傳播效率有影響方面的研究結論也是如此，一方面，在泰國的一項研究顯示，泰國的E亞型的性傳播效率是美國B亞型的5倍，另一方面，Mastro和Shatter等人的研究結果有提示在性傳播和母嬰傳播上，各亞型之間是沒有顯著差異的。