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計算基因組學研究方面獲新進展

2011-02-15 14:29 醫(yī)學教育網(wǎng)
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  近日,上海交通大學張大兵教授指導的博士生王叢茂在基因組重測序數(shù)據(jù)的壓縮研究上獲得新突破。該項研究建立了一種新的基于參考基因組序列的個體基因組重測序數(shù)據(jù)的壓縮方法GRS,改變了現(xiàn)有個體基因組重測序數(shù)據(jù)的壓縮管理方法;為研究基因組SNPs,Indels及SVs提供了更好的計算思路,并且為基于染色體水平的計算分子進化和比較基因組學的發(fā)展提供了借鑒意義。該論文發(fā)表在分子生物學領域的著名刊物《Nucleic Acids Research》上。

  王叢茂是2008年上海交通大學跨學科招生錄取的學生,該同學在本科階段學習的自動化控制專業(yè)基礎上,結合生命科學研究特點,開展生物信息交叉科學學習和研究工作,在此次文章發(fā)表之前,王叢茂同學開發(fā)了一套適合雙端高通量測序技術的染色質免疫沉淀-測序(CHIP-Seq)DNA-蛋白質結合位點的計算方法,并以第一作者身份在生物信息領域高質量期刊《BMC Bioinformatics》上發(fā)表了這個結果醫(yī)學`教育網(wǎng)搜集整理。

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