蠶食性角膜潰瘍的診斷是排除性的。盡管角膜潰瘍有典型的形態(tài)，但必須排除其他幾種周邊性角膜潰瘍。因?yàn)橹苓呅越悄と芙夂铜h(huán)形浸潤也見于膠原血管性疾病，例如類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、結(jié)節(jié)性動脈炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、Wegeners肉芽腫等疾病。在上述全身性疾病中，角膜潰瘍也表現(xiàn)為周邊角膜的浸潤，沿角膜緣進(jìn)展或向角膜中央發(fā)展。然而，膠原血管性疾病的病史和陽性的血清學(xué)檢測結(jié)果（包括類風(fēng)濕因子、抗核抗體、抗中性粒細(xì)胞胞漿抗體等）均有助于與蠶食性角膜潰瘍相鑒別。

　　合并有瞼緣炎的葡萄球菌性周邊性角膜炎與蠶食性角膜潰瘍的鑒別在于前者無明顯眼痛，在角膜浸潤和角膜緣之間有一透明區(qū)，局部應(yīng)用皮質(zhì)類固醇治療后潰瘍迅速好轉(zhuǎn)。

　　Terriens周邊角膜變性是一種周邊角膜變薄的疾患，通常位于上方周邊角膜，雙眼發(fā)病，一般不伴有眼痛和炎癥。角膜上皮完整，變薄區(qū)緩慢向角膜中央進(jìn)展，醫(yī)學(xué)教育`網(wǎng)搜集整理但很少累及中央角膜，沒有穿鑿樣邊緣，脂質(zhì)沉著通常見于角膜變薄區(qū)的前緣，常伴有角膜新生血管。