真菌引起的疾病稱為真菌病。真菌種類很多，與細菌相比，對人致病者相對較少，約150種。近年來由于廣譜抗生素、腎上腺皮質激素和免疫抑制劑的大量應用，真菌感染有明顯增長。真菌病根據(jù)病變部位不同可分成淺部真菌病和深部真菌病兩大類。淺部真菌病主要侵犯含有角質的組織，如皮膚、毛發(fā)和指甲等處，引起各種癬病。深部真菌病侵犯皮膚深層和內臟，如肺、腦、消化道等器官，危害性較大。

真菌一般不產生外毒素，其致病作用可能與真菌在體內繁殖引起的機械性損傷以及所產生的酶類、酸性代謝產物有關。真菌及其代謝產物具有弱抗原性，在人體內可引起變態(tài)反應導致組織損傷。真菌的致病力一般較弱，與其致病力有關的因素是感染量和毒力，感染途徑和機體免疫狀態(tài)。只有當機體抵抗力降低時才能侵入組織，大量繁殖引起疾病。造成機體抵抗力降低，誘發(fā)深部真菌病的因素有以下幾種：①慢性消耗性疾病，如惡性腫瘤、糖尿病和尿毒癥等，可使機體免疫功能和抵抗力降低；②長期使用廣譜抗生素，敏感的細菌被抑制，消除了正常菌群中與真菌相拮抗的細菌，使真菌得以大量繁殖。有些抗生素可促進某些真菌的生長，如金霉素可促進念珠菌生長；③腎上腺皮質激素可抑制炎癥反應和纖維細胞增生，并可穩(wěn)定細胞內溶酶體的膜，阻止其中酶的釋放，影響中性粒細胞和巨噬細胞溶解殺滅微生物的作用。腎上腺皮質激素還能破壞淋巴細胞，使抗體形成減少；④大劑量X線照射、抗腫瘤藥物和免疫抑制劑都能抑制骨髓，使中性粒細胞和巨噬細胞減少，機體的免疫功能和抵抗力降低。這些藥物并可損傷正常組織和細胞，引起消化道粘膜壞死、出血，為真菌侵入創(chuàng)造條件；⑤治療用的長時間靜脈插管，留置導尿管和大手術，可引起局部損傷，成為真菌侵入的門戶，在機體抵抗力低落時在體內繁殖致病。

診斷真菌病有四種基本方法：臨床表現(xiàn)，真菌學、免疫學和病理學。最直接的方法是能證明真菌存在于組織中，或在滲出物中可分離培養(yǎng)。病理組織學的改變只有少數(shù)病變具有特征性。