北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院（簡(jiǎn)稱院校）實(shí)行院校合一的管理體制，相互依托，優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)，教研相長(zhǎng)。她面向全國(guó)，承擔(dān)著科研、教學(xué)、醫(yī)療三大任務(wù)。

院校的研究生教育始于1954年，截至1965年共招收培養(yǎng)研究生210余人（無(wú)學(xué)位）。“文革”期間，研究生教育被迫中斷達(dá)10年之久。1978年院校恢復(fù)研究生招生，是國(guó)務(wù)院首批批準(zhǔn)可授予博士、碩士學(xué)位的單位，也是實(shí)行單獨(dú)考試和可面向港澳臺(tái)招生的院校之一。1982年組成了第一屆院校學(xué)位評(píng)定委員會(huì)，并于1982年首次授予碩士學(xué)位，1985年首次授予博士學(xué)位，揭開(kāi)了院校研究生教育史上新的一頁(yè)。1986年7月成立研究生院，統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)院校的學(xué)位與研究生教育工作，1996年10月順利通過(guò)國(guó)務(wù)院學(xué)位辦對(duì)33所研究生院的合格評(píng)估并正式掛牌。

北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院研究生院現(xiàn)下設(shè)綜合辦公室、招生辦公室、培養(yǎng)辦公室和學(xué)位與學(xué)科建設(shè)辦公室；同時(shí)，依托分布在全國(guó)6省（市）的29個(gè)研究生培養(yǎng)單位（19個(gè)所屬單位及10個(gè)單位）醫(yī)學(xué)教育|網(wǎng)搜集整理，形成了院校——所院兩級(jí)系統(tǒng)完整的多層次多類型的人才培養(yǎng)體系。目前，普通全日制在校研究生達(dá)3100余人。20多年來(lái)，協(xié)和畢業(yè)研究生達(dá)13000余人，授予碩士學(xué)位5400余人、博士學(xué)位4600余人，他們?yōu)閲?guó)家醫(yī)藥衛(wèi)生、科技和教育事業(yè)的發(fā)展做出了重要貢獻(xiàn)。