導致和影響農藥殘留的原因有很多，其中農藥本身的性質、環(huán)境因素以及農藥的使用方法是影響農藥殘留的主要因素。

農藥性質與農藥殘留

現(xiàn)已被禁用的有機砷、汞等農藥，由于其代謝產物砷、汞最終無法降解而殘存于環(huán)境和植物體中。

六六六、滴滴涕等有機氯農藥和它們的代謝產物化學性質穩(wěn)定，在農作物及環(huán)境中消解緩慢，同時容易在人和動物體脂肪中積累。因而雖然有機氯農藥及其代謝物毒性并不高，但它們的殘毒問題仍然存在。

有機磷、氨基甲酸酯類農藥化學性質不穩(wěn)定，在施用后，容易受外界條件影響而分解。但有機磷和氨基甲酸酯類農藥中存在著部分高毒和劇毒品種，如甲胺磷、對硫磷、涕滅威、克百威、水胺硫磷等，如果被施用于生長期較短、連續(xù)采收的蔬菜，則很難避免因殘留量超標而導致人畜中毒。

另外，一部分農藥雖然本身毒性較低，但其生產雜質或代謝物殘毒較高，如二硫代氨基甲酸酯類殺菌劑生產過程中產生的雜質及其代謝物乙撐硫脲屬致癌物，三氯殺螨醇中的雜質滴滴涕，丁硫克百威、丙硫克百威的主要代謝物克百威和3-羥基克百威等。

農藥的內吸性、揮發(fā)性、水溶性、吸附性直接影響其在植物、大氣、水、土壤等周圍環(huán)境中的殘留。

溫度、光照、降雨量、土壤酸堿度及有機質含量、植被情況、微生物等環(huán)境因素也在不同程度上影響著農藥的降解速度，影響農藥殘留。

使用方法與農藥殘留

一般來講，乳油、懸浮劑等用于直接噴灑的劑型對農作物的污染相對要大一些。而粉劑由于其容易飄散而對環(huán)境和施藥者的危害更大。

任何一個農藥品種都有其適合的防治對象、防治作物，有其合理的施藥時間、使用次數(shù)、施藥量和安全間隔期（最后一次施藥距采收的安全間隔時間）。合理施用農藥能在有效防治病蟲草害的同時，減少不必要的浪費，降低農藥對農副產品和環(huán)境的污染，而不加節(jié)制地濫用農藥，必然導致對農產品的污染和對環(huán)境的破壞。