一是以整體觀念為指導(dǎo)，保持中醫(yī)學(xué)基本理論的特色。

　　中醫(yī)學(xué)的基本理論受道家思想的影響。道家主張“天下萬物生于有，有生于無”，“道生一，一生二，二生三，三生萬物”；中醫(yī)學(xué)強調(diào)人體自身的整體性，包括各個部分的全息性和部分之間的聯(lián)系性。中醫(yī)學(xué)以整體思維來研究人體，認為任何一個部分的機能都是整體機能的反映。西醫(yī)學(xué)運用解剖分析還原方法來研究人體，是由部分到整體的思維。按照中醫(yī)學(xué)的整體思維，來研究人體的某一具體的臟腑經(jīng)絡(luò)組織器官的某一功能，是由整體到部分的研究思路。中醫(yī)與西醫(yī)的研究思路雖然不同，但研究的對象都是人體，兩種不同的研究必然會產(chǎn)生一個交會點，這可能就是揭示人體生命規(guī)律的目標點。就目前來說，“證”的研究可能是中醫(yī)理論與臨床研究的突破點。因為證是中醫(yī)學(xué)整體思維和辨證論治思想的集中反映，證的病理模型研制、客觀化研究和機理研究是按照中醫(yī)學(xué)研究思路而作的探索，應(yīng)是提倡和鼓勵的研究思路和方法。

　　二是將中醫(yī)學(xué)理論納入現(xiàn)代科學(xué)研究序列。

　　中醫(yī)學(xué)應(yīng)屬自然科學(xué)，當以自然科學(xué)的研究方法來研究和發(fā)展中醫(yī)學(xué)理論。結(jié)合目前中醫(yī)學(xué)理論研究的實際，提出以下研究思路：即在明確某一理論和概念之內(nèi)涵的基礎(chǔ)上，抓住某一點或某一環(huán)節(jié)進行細致的深層次的微觀研究。或探討其內(nèi)在的機制或機理，或以現(xiàn)代實驗技術(shù)建立證的病理模型的方法，以求建立證的評價標準，或?qū)δ骋焕碚撟鞒隹茖W(xué)的闡釋，或找到某一方藥的作用部位或作用環(huán)節(jié)。如對肺主行水理論的研究，在確定其理論內(nèi)涵的基礎(chǔ)上，以現(xiàn)代的科學(xué)實驗技術(shù)和方法，建立肺行水與呼吸相關(guān)的病理模型——寒飲蘊肺證家兔病理模型，在研究和確立該證評價標準的同時，也從某一側(cè)面得出肺行水的內(nèi)在機理，同時也可找到治療該證的溫陽化飲方的作用環(huán)節(jié)或作用部位。因而可從細胞和分子生物學(xué)角度對肺主行水的理論作出科學(xué)的闡釋。

　　三是繼續(xù)強化中醫(yī)學(xué)在思維方法和人文科學(xué)方面的研究。

　　在繼續(xù)傳統(tǒng)思維方法研究的同時注重革新。精氣陰陽五行學(xué)說是作為一種思維方法而滲透于中醫(yī)學(xué)的，它們在中醫(yī)學(xué)理論體系的構(gòu)筑過程中起了重要的方法學(xué)作用，但它們并非中醫(yī)學(xué)固有的概念或理論。古代哲學(xué)的精氣陰陽五行學(xué)說是作為一種方法或一種解釋性模型來說明中醫(yī)學(xué)的臟腑經(jīng)絡(luò)精氣血津液的作用和功能的，來闡釋人體的生命活動規(guī)律的。就目前而言，它們?nèi)允侵嗅t(yī)學(xué)的主要思維方法，其合理的內(nèi)核，科學(xué)的精髓以及方法學(xué)方面的作用，仍有繼續(xù)深入發(fā)掘的必要。勿庸諱言，隨著中醫(yī)學(xué)理論的繼承性研究和現(xiàn)代實驗研究的發(fā)展和深入，古代哲學(xué)思想對中醫(yī)學(xué)的影響將越來越被淡化。實際上，中醫(yī)學(xué)若作為一門自然科學(xué)繼續(xù)發(fā)展，不可能永遠與兩千年前的哲學(xué)思想——精氣陰陽五行諸學(xué)說綁在一起。中醫(yī)學(xué)的某些帶有陰陽痕跡的術(shù)語如腎陰腎陽等，到時也只會是一些內(nèi)涵明確的概念，已不再具備哲學(xué)的陰陽概念和運動規(guī)律了。

　　要注重中醫(yī)學(xué)思維方法的革新，在發(fā)掘傳統(tǒng)思維方法如宏觀、整體、類比、外揣等的同時，開展微觀、局部、邏輯、系統(tǒng)等思維方法的研究，構(gòu)建中醫(yī)學(xué)的新的方法學(xué)體系。中醫(yī)學(xué)理論的發(fā)展和創(chuàng)新，只用傳統(tǒng)的思維方法來研究是遠遠不夠的，必須注重和發(fā)展在整體觀念指導(dǎo)下的局部的、形體的、微觀的研究。

　　同時，強化中醫(yī)學(xué)在人文科學(xué)方面的發(fā)展。“生物—心理—社會”現(xiàn)代醫(yī)學(xué)模式在70年代已經(jīng)提出，醫(yī)學(xué)不再是單純的生物醫(yī)學(xué)，已經(jīng)融合進了諸多人文社會學(xué)科的知識，心身醫(yī)學(xué)的發(fā)展就說明了這一點。中醫(yī)學(xué)受古代哲學(xué)的深刻影響，也融有大量的社會學(xué)知識。中醫(yī)學(xué)整體思想的建立，強調(diào)自然和社會環(huán)境對人體的影響，就是這種思想的反映。但中醫(yī)學(xué)中的人文社會學(xué)知識不應(yīng)停留在兩千年前的精氣陰陽五行學(xué)說的水平上，而應(yīng)在吸收古代哲學(xué)思想中精華的基礎(chǔ)上，兼收并蓄古今中外人文科學(xué)中的精華，以充實和發(fā)展中醫(yī)學(xué)理論。

　　四是創(chuàng)建科學(xué)的假說和構(gòu)建新的理論體系。

　　在以繼承性研究確立中醫(yī)學(xué)某一基本理論和概念的內(nèi)涵以及以現(xiàn)代科學(xué)手段對該理論和概念的內(nèi)涵作深化研究的過程中，醫(yī)學(xué)教育|網(wǎng)搜集整理科學(xué)的假說和新的理論就可能孕育產(chǎn)生。如在比較研究中醫(yī)學(xué)的精氣理論與古代哲學(xué)的精氣學(xué)說的過程中，在對藏象概念的內(nèi)涵及其產(chǎn)生根源的探討中，發(fā)現(xiàn)了現(xiàn)行的“臟腑氣血陰陽”理論體系的諸多問題，產(chǎn)生了構(gòu)建“臟腑—精氣—陰陽”理論體系的想法，以科學(xué)地表述臟腑之精、氣、陰陽的概念及其之間的邏輯關(guān)系，并較確切地表述臟腑的生理功能和病理變化。臟腑精氣陰陽理論體系，實際上是一個新的臟腑功能和人體生命活動的解釋性模型，對認識人體生命的來源，說明人體生命的持續(xù)和變化規(guī)律，指導(dǎo)臨床臟腑病證的辨證和治療，具有重要的指導(dǎo)意義。再如在確立肺行水理論的內(nèi)涵及對此理論作深化研究的過程中，我們發(fā)現(xiàn)肺的行水功能與呼吸道的舒縮密切相關(guān)，因而在科學(xué)實驗的基礎(chǔ)上，提出肺陽行水的作用機制可能在于調(diào)節(jié)呼吸道的舒縮的假說。

　　備注：中醫(yī)學(xué)是否屬于自然科學(xué)是個大問題，和中醫(yī)科學(xué)與否的爭論一樣，不同人有不同的看法。上文第二點所提及的“將中醫(yī)學(xué)理論納入現(xiàn)代科學(xué)研究序列”，是在探討中醫(yī)學(xué)的一個研究方向。在這個研究方向上，基本上有兩個觀點：一個是回歸傳統(tǒng)，就是強調(diào)繼承，從中醫(yī)經(jīng)典中繼承、發(fā)展中醫(yī)；一個是所謂的中醫(yī)科學(xué)化，就是利用現(xiàn)代的科學(xué)技術(shù)及科學(xué)方法來研究中醫(yī)。各家對此皆有爭論，本文僅供參考。