周 皮（或表皮）：應注意木栓細胞的形狀、層數(shù)、增厚情況等（詳見皮類中藥），幼嫩莖的周皮尚不發(fā)達，常可見表皮組織。

皮 層：注意其存在與否及在橫切面所占比例。初生構造的皮層有時具有厚角組織或厚壁組織，莖次生構造木栓形成層如發(fā)生在皮層以內，則皮層就不存在而由栓內層（次生皮層）所代替。注意觀察細胞的形態(tài)及內含物等。

韌皮部：應注意韌皮薄壁組織、篩管和韌皮射線以及有無厚壁組織等，以及各種細胞的形態(tài)及排列情況。

韌皮部外方常有初生韌皮纖維束或周纖維（環(huán)管纖維），過去曾稱中柱鞘纖維。

形成層：一般都成環(huán)狀，注意是否明顯。

木質部：注意導管、木薄壁細胞、木纖維及木射線細胞的形狀和排列情況。木質藤本導管孔徑較大。

髓 部：大多由薄壁細胞構成，多具明顯的細胞間隙，細胞有時可見圓形單紋孔，有的髓周具厚壁細胞，散在或形成環(huán)髓纖維或環(huán)髓石細胞。草質莖髓部較發(fā)達，木質莖髓部較小。

注意點：莖類中藥鑒別除應注意以上各類組織的排列、各種細胞的分布、特別是除石細胞和纖維外，還應注意細胞內含物如草酸鈣結晶、碳酸鈣結晶和淀粉粒的有無以及它們的形狀等。對于存在于不同部位的厚壁組織如周纖維、韌皮纖維和木纖維等，應分別通過解離組織仔細觀察它們的形狀、細胞壁的厚度、有無壁孔和分隔以及木化程度等加以區(qū)別。

雙子葉植物木質藤莖，在外部形態(tài)和內部組織構造上和一般的莖藤有時有較大的差別：如木栓層較厚；有的有明顯的落皮層；維管束常被射線分隔成明顯的放射狀；導管孔較大；維管束有的具異常構造，有的有內函韌皮部（Included Phloem）或內生韌皮部（Internal Phloem）。在縱向切面尚可見到射線的寬度與高度。這些在鑒定上都具有重要意義。