醫(yī)改過后雖然對鄉(xiāng)村醫(yī)生的待遇問題等都做出了改變，但是仍有很多的問題存在。

一 勞動報酬問題

根據(jù)《鄉(xiāng)村醫(yī)生從業(yè)管理條例》第23條之規(guī)定，鄉(xiāng)村醫(yī)生有獲取勞動報酬的權(quán)利。然而，藥品實行零差率銷售以來，在國家給鄉(xiāng)村醫(yī)生所謂的補助被層層打折扣、超低標準的診療服務(wù)費情況下，鄉(xiāng)村醫(yī)生將衛(wèi)生室（站）正常運轉(zhuǎn)費用開支以后所得的收入已所剩無幾，人平基本上都只有幾百元每月，似乎有點少得可憐，與當前社會的平均工資差距甚遠。很明顯，鄉(xiāng)村醫(yī)生的勞動付出根本沒有得到相應(yīng)的報酬。

二 勞動保障問題

鄉(xiāng)村醫(yī)生零差率為農(nóng)民看病、搞新農(nóng)合門診補償、搞公共衛(wèi)生服務(wù)，這都是在給政府做事，這是典型的掛醫(yī)生牌子不看病人確在干公務(wù)員的工作不拿公務(wù)員的工資。另外鄉(xiāng)村醫(yī)生在工作中生點小病、受點小傷咱也無所謂，可一旦受重傷致殘或不幸死亡，也只能自認倒霉，得不到政府的認定、得不到撫慰、得不到補償、甚至連一句安慰的話都得不到。遭此劫難而離去的鄉(xiāng)村醫(yī)生們一定死不瞑目。都說哀莫大于心死，我認為哀莫大于死不瞑目。這使全國100萬鄉(xiāng)村醫(yī)生心寒、心痛，這種痛是來自內(nèi)心深處的痛，是一種難以言表的痛。

三 醫(yī)療風險問題

鄉(xiāng)村醫(yī)生在醫(yī)療服務(wù)過程中一旦發(fā)生事故（患者死亡、殘疾），那就是天大的事、是連想都不敢想的事、是讓鄉(xiāng)村醫(yī)生一輩子站不起來的事。這個問題在實行藥品零差率銷售之后更加凸顯。鄉(xiāng)村醫(yī)生實在是太弱小了，憑鄉(xiāng)村醫(yī)生個人的力量是扛不了醫(yī)療風險的。國家如果還用得上鄉(xiāng)村醫(yī)生的話，必須拿出行之有效的辦法幫鄉(xiāng)村醫(yī)生化解醫(yī)療風險。

四 公共衛(wèi)生任務(wù)繁重的問題

到目前為止，許多鄉(xiāng)鎮(zhèn)衛(wèi)生院（院長）一直在渾水摸魚、趁火打劫。他們在克扣鄉(xiāng)村醫(yī)生補助的同時，還肆意增加鄉(xiāng)村醫(yī)生公共衛(wèi)生服務(wù)量。盡管國務(wù)院明文規(guī)定讓鄉(xiāng)村醫(yī)生承擔40%公共衛(wèi)生服務(wù)并獲取相應(yīng)的服務(wù)經(jīng)費。實際上，鄉(xiāng)村醫(yī)生承擔了80%以上的公共衛(wèi)生服務(wù)，而獲取的服務(wù)費只在20%以下。對此，鄉(xiāng)村醫(yī)生不敢怒也不敢言。如果這一問題不得到解決，它將成為壓死鄉(xiāng)村醫(yī)生的最后一根稻草。